Важнейшие результаты научных исследований:

1. Разработан проект Федерального закона "Об охране среды Ладожского озера и его бассейна".
2. Разработана концепция экологического мониторинга Ладожского озера, которая имеет комплексный характер и базируется на оценке состояния водной среды и донных отложений по совокупности гидрофизических, гидрохимических, гидробиологических и токсикологических показателей, учитывая пространственно-временную неоднородность в развитии природных процессов по акватории озера и антропогенного прессинга от разных частей водосбора.
3. На основе многолетнего изучения структуры и функционирования экосистемы Ладожского озера выполнены работы по методологии экологического нормирования, позволяющего ограничивать антропогенное воздействие рамками экологического потенциала озера.
4. По результатам комплексного изучения современного экологического состояния водной системы "Ладожское озеро - река Нева - Финский залив" количественно оценена роль Ладожского озера в формировании качества воды Финского залива.
5. Выявлена цикличность многолетней динамики уловов промысловых рыб в Ладожском озере.
6. Разработаны научные основы восстановления водных объектов (озера, болота) Северо-Западного региона России в условиях нефтезагрязнения.
7. Разработаны рекомендации по восстановлению экосистем малых озер при антропогенном эвтрофировании, учитывающие в качестве основной меры уменьшение внешней биогенной нагрузки и снижение фосфороудерживающей способности водоема.
8. Разработан комплекс математических моделей миграции и трансформации веществ в системе "Атмосфера - водосбор - водоем - донные отложения ".
9. Создан авторский макет ресурсно-экологического Атласа Ладожского озера и его бассейна для издания полиграфическим способом и в электронном варианте.
10. Разработан научный прогноз эвтрофирования озер и сдерживания этого процесса. В основу ее положены результаты изучения структурно-функциональных особенностей озерных экосистем и их эволюции во времени в различных физико-географических зонах под влиянием климатических и антропогенных факторов.
11. Впервые выполнены фундаментальные научные палеолимнологические обобщения по теории эволюции озер на территории бывшего СССР в геологическом прошлом и в современных условиях (от палеозоя до наших дней). Результаты этих исследований опубликованы в 9-ти томной серии монографий "История озер".
12. Выполняются фундаментальные теоретические исследования по физической лимнологии, включающие результаты теоретических разработок, экспертных и натурных исследований по изучению, параметризации и моделированию внутриводоемных процессов и процессов тепломассопереноса в системе "водоем - водосбор". Наиболее важным достижением в этом направлении исследований является создание теории термического бара и термоклина, теории турбулентного перемешивания под слоем скачка, гидротермо-динамического взаимодействия в пограничных средах ("вода - атмосфера", "вода - донные отложения").